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细胞凋亡进程启动后，内部钙离子浓度升高，细胞开始剧烈收缩，细胞核内部所有染色体碱基序列会被新合成的特种蛋白酶剪切成很小的碱基片段，同所有的细胞器一起，变成很多个被破裂的细胞膜包裹的碎块，最终这些细胞的残骸会被周围的细胞或者机体内的吞噬细胞彻底分解，然后重新利用。
整个凋亡过程由多个基因严格控制，细胞有步骤，有规律的从正常组织中降解和消失，机体无炎症反应，而且对整个机体的发育没有严重负面影响，它的位置和功能会被其他细胞有序取代。
这种严格的凋亡机制有利有弊，有利的地方就是不依赖于一个基因调控，即便是一两个基因不能发挥作用，也会启动相应的措施，即便不能让细胞完整有序凋亡，也可以使致癌细胞不能造成太大危害。
但是，当这些参与凋亡进程的基因也大部分不能
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